Międzyszkolny Klub Sportowy jest kontynuacją tradycji piłki ręcznej w Grudziądzu, którą datuje się od roku 1950. Wówczas w ramach klubu sportowego „RUCH” Grudziądz działającego przy zakładach przemysłu gumowego „Pe-Pe-Ge” powołano sekcję piłki ręcznej.

W roku 1998 próby reaktywowania sekcji piłki ręcznej w Grudziądzu podjęło się grono działaczy, byłych zawodników i miłośników sportu. Od tego czasu sekcja piłki ręcznej rozwija się dynamicznie i rokrocznie zgłasza drużyny kolejnych roczników we wszystkich kategoriach wiekowych.

W 2005 roku powstała, zbudowana w oparciu o wychowanków klubu, pierwsza drużyna seniorów, która już w 2006 roku awansowała do II ligi mężczyzn. W 2015 roku drużynie udało się awansować do zaplecza PGNiG Superligi.